Bakopa drobnolistna przyjmowana zgodnie z zaleceniami dotyczącymi jej przyjmowania wydaje się, że nie wywołuje skutków ubocznych. Jednakże bakopa drobnolistna przyjmowana na czczo może powodować biegunki, wzdęcia czy nudności. Negatywne efekty ze strony układu pokarmowego mogą być obserwowane częściej u osób starszych.